Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL12P30050 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL12P30050 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL12P30050 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL12P30050 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL12P30050 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL12P30050 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL12P30050 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL12P30050 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL12P30050 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL12P30050 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL12P30050 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL12P30050 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL12P30050 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL12P30050 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL12P30050 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL12P30050 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL12P30050 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL12P30050 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL12P30050 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL12P30050 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL12P30050 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL12P30050 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL12P30050 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL12P30050 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL12P30050 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL12P30050 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL12P30050 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL12P30050 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL12P30050 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL12P30050 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL12P30050 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL12P30050 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL12P30050 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL12P30050 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL12P30050 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL12P30050 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL12P30050 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL12P30050 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL12P30050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL12P30050 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL12P30050 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL12P30050 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL12P30050 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL12P30050 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL12P30050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL12P30050 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL12P30050 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL12P30050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL12P30050 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL12P30050 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL12P30050 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL12P30050 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL12P30050 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL12P30050 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL12P30050 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL12P30050 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL12P30050 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL12P30050 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL12P30050 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL12P30050 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL12P30050 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL12P30050 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL12P30050 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL12P30050 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL12P30050 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL12P30050 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL12P30050 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL12P30050 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL12P30050 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL12P30050 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL12P30050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL12P30050 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL12P30050 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL12P30050 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL12P30050 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL12P30050 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL12P30050 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL12P30050 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL12P30050 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL12P30050 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL12P30050 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL12P30050 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL12P30050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL12P30050 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL12P30050 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL12P30050 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL12P30050 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL12P30050 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL12P30050 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL12P30050 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL12P30050 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL12P30050 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL12P30050 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL12P30050 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL12P30050 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL12P30050 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL12P30050 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL12P30050 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL12P30050 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms