Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA4P25789 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMA4P25789 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA4P25789 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA4P25789 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMA4P25789 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMA4P25789 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA4P25789 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA4P25789 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMA4P25789 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA4P25789 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA4P25789 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA4P25789 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms