Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM3P25205 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM3P25205 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM3P25205 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM3P25205 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM3P25205 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM3P25205 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3P25205 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3P25205 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM3P25205 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM3P25205 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3P25205 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3P25205 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3P25205 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3P25205 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM3P25205 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM3P25205 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3P25205 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3P25205 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM3P25205 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM3P25205 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM3P25205 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3P25205 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM3P25205 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM3P25205 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3P25205 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3P25205 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3P25205 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3P25205 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM3P25205 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM3P25205 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM3P25205 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM3P25205 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3P25205 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3P25205 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3P25205 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3P25205 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3P25205 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3P25205 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3P25205 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3P25205 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM3P25205 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM3P25205 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM3P25205 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3P25205 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3P25205 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3P25205 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM3P25205 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM3P25205 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM3P25205 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM3P25205 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM3P25205 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM3P25205 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM3P25205 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3P25205 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3P25205 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3P25205 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3P25205 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM3P25205 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCM3P25205 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCM3P25205 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3P25205 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3P25205 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3P25205 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM3P25205 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM3P25205 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3P25205 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM3P25205 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM3P25205 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM3P25205 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM3P25205 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM3P25205 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM3P25205 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3P25205 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM3P25205 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM3P25205 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM3P25205 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM3P25205 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM3P25205 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM3P25205 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM3P25205 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM3P25205 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM3P25205 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM3P25205 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM3P25205 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3P25205 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3P25205 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3P25205 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM3P25205 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM3P25205 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3P25205 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3P25205 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3P25205 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3P25205 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3P25205 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3P25205 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3P25205 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM3P25205 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM3P25205 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM3P25205 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms