Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 515.54■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 TRABD2B-201ENST00000435576 619 ntTSL 313.42□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 413.15□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-206ENST00000562144 574 ntTSL 410.75□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SUPT4H1-206ENST00000581204 539 ntTSL 28.28□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.064e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 521.17■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 TMOD3-203ENST00000558455 447 ntTSL 320.4■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-213ENST00000583631 546 ntTSL 522.42■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-212ENST00000582721 594 ntTSL 418.56■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-215ENST00000584413 577 ntTSL 415.21■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-208ENST00000577594 481 ntTSL 213.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 411.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-206ENST00000526547 731 ntTSL 516.29■□□□□ 0.25e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-207ENST00000527311 638 ntTSL 315.64■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-202ENST00000372779 588 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 EXOSC7-204ENST00000467846 1149 ntTSL 212.02□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-216ENST00000641548 507 nt11.53□□□□□ -0.565e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 EXOSC7-208ENST00000482004 559 ntTSL 49.5□□□□□ -0.895e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-205ENST00000427472 709 ntTSL 39.18□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-204ENST00000523245 799 ntTSL 26.72□□□□□ -1.335e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-202ENST00000518786 827 ntTSL 25.02□□□□□ -1.615e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-203ENST00000521286 759 ntTSL 34.94□□□□□ -1.625e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.685e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.985e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.035e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.155e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.165e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.35e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.435e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO4A1-203ENST00000451793 856 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 IMPAD1-202ENST00000517461 487 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-32■■■■■ 60.3
RPS3P23396 SLCO4A1-209ENST00000497919 440 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 TMEM33-206ENST00000510383 697 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 SLCO4A1-204ENST00000466818 556 ntTSL 38.75□□□□□ -1.011e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-36■■■■■ 59.4
RPS3P23396 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-36■■■■■ 59.4
RPS3P23396 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-36■■■■■ 58.9
RPS3P23396 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-36■■■■■ 58.9
RPS3P23396 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 51.49□□□□□ -2.171e-9■■■■■ 58.8
RPS3P23396 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 27.24□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 58.7
RPS3P23396 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 23.83□□□□□ -1.87e-11■■■■■ 58.7
RPS3P23396 BLMH-206ENST00000578795 2079 nt7.99□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 58.2
RPS3P23396 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 58.2
RPS3P23396 GAGE1-201ENST00000381700 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-203ENST00000610680 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-202ENST00000381709 3129 ntTSL 27.25□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 APOL1-211ENST00000439680 531 ntTSL 411.89□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 57.9
RPS3P23396 NDUFS4-206ENST00000509443 450 ntTSL 21.26□□□□□ -2.214e-12■■■■■ 57.6
RPS3P23396 RPL9-206ENST00000504470 689 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 57.5
RPS3P23396 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 42.61□□□□□ -1.993e-7■■■■■ 57.5
RPS3P23396 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 28.88□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 57.4
RPS3P23396 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.115e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.011e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 214.03□□□□□ -0.165e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 PLA2G15-207ENST00000565460 3121 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 26.17□□□□□ -1.422e-20■■■■■ 57
RPS3P23396 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-15■■■■■ 57
RPS3P23396 MPZL2-204ENST00000527282 908 ntTSL 215.14■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-203ENST00000525647 476 ntTSL 414.55□□□□□ -0.085e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-206ENST00000529376 1531 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.012e-11■■■■■ 56.3
RPS3P23396 EMC4-207ENST00000558810 652 ntTSL 214.03□□□□□ -0.166e-10■■■■■ 56.3
RPS3P23396 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-45■■■■■ 56.1
RPS3P23396 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 56.1
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