Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 515.54■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 TRABD2B-201ENST00000435576 619 ntTSL 313.42□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 413.15□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-206ENST00000562144 574 ntTSL 410.75□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SUPT4H1-206ENST00000581204 539 ntTSL 28.28□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.064e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 521.17■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 TMOD3-203ENST00000558455 447 ntTSL 320.4■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-213ENST00000583631 546 ntTSL 522.42■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-212ENST00000582721 594 ntTSL 418.56■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-215ENST00000584413 577 ntTSL 415.21■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-208ENST00000577594 481 ntTSL 213.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 411.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-206ENST00000526547 731 ntTSL 516.29■□□□□ 0.25e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-207ENST00000527311 638 ntTSL 315.64■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-202ENST00000372779 588 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 EXOSC7-204ENST00000467846 1149 ntTSL 212.02□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 PPT1-216ENST00000641548 507 nt11.53□□□□□ -0.565e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 EXOSC7-208ENST00000482004 559 ntTSL 49.5□□□□□ -0.895e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-205ENST00000427472 709 ntTSL 39.18□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-204ENST00000523245 799 ntTSL 26.72□□□□□ -1.335e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-202ENST00000518786 827 ntTSL 25.02□□□□□ -1.615e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-203ENST00000521286 759 ntTSL 34.94□□□□□ -1.625e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.685e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.985e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.035e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.155e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.165e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.35e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.435e-9■■■■■ 60.7
RPS3P23396 SLCO4A1-203ENST00000451793 856 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 IMPAD1-202ENST00000517461 487 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-32■■■■■ 60.3
RPS3P23396 SLCO4A1-209ENST00000497919 440 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 TMEM33-206ENST00000510383 697 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 SLCO4A1-204ENST00000466818 556 ntTSL 38.75□□□□□ -1.011e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-11■■■■■ 60.3
RPS3P23396 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-36■■■■■ 59.4
RPS3P23396 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-36■■■■■ 59.4
RPS3P23396 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-36■■■■■ 58.9
RPS3P23396 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-36■■■■■ 58.9
RPS3P23396 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 51.49□□□□□ -2.171e-9■■■■■ 58.8
RPS3P23396 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 27.24□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 58.7
RPS3P23396 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 23.83□□□□□ -1.87e-11■■■■■ 58.7
RPS3P23396 BLMH-206ENST00000578795 2079 nt7.99□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 58.2
RPS3P23396 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 58.2
RPS3P23396 GAGE1-201ENST00000381700 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-203ENST00000610680 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-202ENST00000381709 3129 ntTSL 27.25□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 58.1
RPS3P23396 APOL1-211ENST00000439680 531 ntTSL 411.89□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 57.9
RPS3P23396 NDUFS4-206ENST00000509443 450 ntTSL 21.26□□□□□ -2.214e-12■■■■■ 57.6
RPS3P23396 RPL9-206ENST00000504470 689 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 57.5
RPS3P23396 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 42.61□□□□□ -1.993e-7■■■■■ 57.5
RPS3P23396 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 28.88□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 57.4
RPS3P23396 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.115e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.011e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-38■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 214.03□□□□□ -0.165e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 PLA2G15-207ENST00000565460 3121 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-11■■■■■ 57.3
RPS3P23396 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 57
RPS3P23396 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 26.17□□□□□ -1.422e-20■■■■■ 57
RPS3P23396 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-15■■■■■ 57
RPS3P23396 MPZL2-204ENST00000527282 908 ntTSL 215.14■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-203ENST00000525647 476 ntTSL 414.55□□□□□ -0.085e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-206ENST00000529376 1531 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 56.9
RPS3P23396 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 56.3
RPS3P23396 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.012e-11■■■■■ 56.3
RPS3P23396 EMC4-207ENST00000558810 652 ntTSL 214.03□□□□□ -0.166e-10■■■■■ 56.3
RPS3P23396 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-45■■■■■ 56.1
RPS3P23396 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 56.1
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