Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPLP06858 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPLP06858 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPLP06858 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPLP06858 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPLP06858 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPLP06858 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPLP06858 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPLP06858 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPLP06858 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LPLP06858 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPLP06858 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPLP06858 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPLP06858 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPLP06858 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPLP06858 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPLP06858 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPLP06858 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPLP06858 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LPLP06858 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPLP06858 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPLP06858 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPLP06858 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPLP06858 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPLP06858 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPLP06858 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPLP06858 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPLP06858 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LPLP06858 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPLP06858 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPLP06858 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPLP06858 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPLP06858 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LPLP06858 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPLP06858 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPLP06858 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPLP06858 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPLP06858 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPLP06858 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPLP06858 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPLP06858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPLP06858 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPLP06858 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPLP06858 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPLP06858 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPLP06858 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPLP06858 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPLP06858 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPLP06858 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPLP06858 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPLP06858 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPLP06858 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPLP06858 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPLP06858 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPLP06858 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPLP06858 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPLP06858 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPLP06858 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LPLP06858 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LPLP06858 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPLP06858 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPLP06858 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPLP06858 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPLP06858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPLP06858 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPLP06858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPLP06858 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPLP06858 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPLP06858 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPLP06858 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPLP06858 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPLP06858 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPLP06858 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPLP06858 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPLP06858 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPLP06858 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPLP06858 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPLP06858 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPLP06858 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPLP06858 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPLP06858 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPLP06858 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPLP06858 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPLP06858 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPLP06858 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPLP06858 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPLP06858 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPLP06858 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPLP06858 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPLP06858 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms