Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTMAP06454 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTMAP06454 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTMAP06454 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTMAP06454 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTMAP06454 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTMAP06454 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTMAP06454 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTMAP06454 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTMAP06454 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTMAP06454 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTMAP06454 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTMAP06454 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTMAP06454 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTMAP06454 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTMAP06454 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTMAP06454 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTMAP06454 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTMAP06454 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTMAP06454 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTMAP06454 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTMAP06454 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMAP06454 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMAP06454 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMAP06454 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTMAP06454 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTMAP06454 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTMAP06454 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMAP06454 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMAP06454 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMAP06454 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMAP06454 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTMAP06454 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMAP06454 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMAP06454 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMAP06454 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTMAP06454 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTMAP06454 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTMAP06454 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTMAP06454 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTMAP06454 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTMAP06454 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTMAP06454 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTMAP06454 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTMAP06454 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMAP06454 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMAP06454 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTMAP06454 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTMAP06454 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTMAP06454 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTMAP06454 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTMAP06454 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTMAP06454 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTMAP06454 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTMAP06454 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTMAP06454 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTMAP06454 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMAP06454 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMAP06454 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMAP06454 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTMAP06454 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTMAP06454 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTMAP06454 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTMAP06454 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTMAP06454 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTMAP06454 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTMAP06454 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMAP06454 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTMAP06454 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTMAP06454 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTMAP06454 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTMAP06454 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTMAP06454 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTMAP06454 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTMAP06454 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTMAP06454 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTMAP06454 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTMAP06454 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTMAP06454 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTMAP06454 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTMAP06454 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTMAP06454 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTMAP06454 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTMAP06454 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTMAP06454 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMAP06454 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMAP06454 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTMAP06454 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTMAP06454 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTMAP06454 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMAP06454 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMAP06454 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMAP06454 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTMAP06454 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMAP06454 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMAP06454 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMAP06454 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTMAP06454 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTMAP06454 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTMAP06454 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms