Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT8P05787 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT8P05787 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT8P05787 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT8P05787 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT8P05787 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT8P05787 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT8P05787 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT8P05787 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT8P05787 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT8P05787 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT8P05787 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT8P05787 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT8P05787 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT8P05787 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT8P05787 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT8P05787 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT8P05787 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT8P05787 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT8P05787 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT8P05787 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT8P05787 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT8P05787 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT8P05787 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT8P05787 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT8P05787 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT8P05787 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT8P05787 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT8P05787 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT8P05787 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT8P05787 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT8P05787 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT8P05787 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT8P05787 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT8P05787 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT8P05787 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT8P05787 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT8P05787 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT8P05787 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT8P05787 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT8P05787 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT8P05787 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT8P05787 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT8P05787 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT8P05787 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT8P05787 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT8P05787 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT8P05787 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT8P05787 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT8P05787 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT8P05787 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT8P05787 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT8P05787 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT8P05787 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT8P05787 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT8P05787 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT8P05787 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT8P05787 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT8P05787 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT8P05787 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT8P05787 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT8P05787 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT8P05787 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT8P05787 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT8P05787 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT8P05787 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT8P05787 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT8P05787 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT8P05787 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT8P05787 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT8P05787 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT8P05787 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT8P05787 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT8P05787 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT8P05787 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT8P05787 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT8P05787 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT8P05787 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT8P05787 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT8P05787 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT8P05787 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT8P05787 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT8P05787 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT8P05787 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT8P05787 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT8P05787 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT8P05787 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT8P05787 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT8P05787 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT8P05787 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT8P05787 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT8P05787 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT8P05787 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT8P05787 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT8P05787 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT8P05787 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT8P05787 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT8P05787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT8P05787 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT8P05787 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms