Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DPB1P04440 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPB1P04440 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DPB1P04440 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPB1P04440 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DPB1P04440 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DPB1P04440 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPB1P04440 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DPB1P04440 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DPB1P04440 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DPB1P04440 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DPB1P04440 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPB1P04440 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DPB1P04440 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPB1P04440 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DPB1P04440 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DPB1P04440 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPB1P04440 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 505.1 ms