Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA1P01562 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA1P01562 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA1P01562 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA1P01562 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA1P01562 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA1P01562 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA1P01562 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFNA1P01562 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA1P01562 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA1P01562 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNA1P01562 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms