Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCTN3O75935 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCTN3O75935 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCTN3O75935 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN3O75935 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCTN3O75935 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCTN3O75935 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCTN3O75935 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN3O75935 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCTN3O75935 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCTN3O75935 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCTN3O75935 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCTN3O75935 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DCTN3O75935 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCTN3O75935 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCTN3O75935 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms