Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX11AO75192 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX11AO75192 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PEX11AO75192 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX11AO75192 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX11AO75192 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX11AO75192 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX11AO75192 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX11AO75192 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX11AO75192 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX11AO75192 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX11AO75192 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX11AO75192 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX11AO75192 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX11AO75192 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX11AO75192 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX11AO75192 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX11AO75192 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX11AO75192 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX11AO75192 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX11AO75192 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX11AO75192 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX11AO75192 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX11AO75192 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX11AO75192 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms