Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EDIL3O43854 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms