Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EDIL3O43854 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EDIL3O43854 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EDIL3O43854 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EDIL3O43854 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EDIL3O43854 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
EDIL3O43854 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EDIL3O43854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EDIL3O43854 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
EDIL3O43854 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EDIL3O43854 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
EDIL3O43854 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDIL3O43854 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms