Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATCO43716 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATCO43716 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATCO43716 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATCO43716 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATCO43716 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATCO43716 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATCO43716 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATCO43716 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATCO43716 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATCO43716 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATCO43716 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATCO43716 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATCO43716 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATCO43716 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATCO43716 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATCO43716 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATCO43716 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATCO43716 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATCO43716 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATCO43716 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATCO43716 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATCO43716 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATCO43716 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATCO43716 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATCO43716 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATCO43716 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATCO43716 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATCO43716 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATCO43716 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATCO43716 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATCO43716 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATCO43716 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATCO43716 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATCO43716 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GATCO43716 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATCO43716 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATCO43716 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATCO43716 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATCO43716 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATCO43716 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATCO43716 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATCO43716 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATCO43716 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATCO43716 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATCO43716 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATCO43716 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATCO43716 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATCO43716 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GATCO43716 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATCO43716 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATCO43716 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATCO43716 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATCO43716 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATCO43716 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATCO43716 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATCO43716 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATCO43716 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GATCO43716 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATCO43716 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATCO43716 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATCO43716 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATCO43716 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATCO43716 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATCO43716 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATCO43716 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATCO43716 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATCO43716 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATCO43716 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATCO43716 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATCO43716 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATCO43716 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATCO43716 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATCO43716 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GATCO43716 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GATCO43716 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATCO43716 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATCO43716 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATCO43716 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATCO43716 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATCO43716 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATCO43716 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATCO43716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATCO43716 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATCO43716 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATCO43716 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATCO43716 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATCO43716 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATCO43716 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATCO43716 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATCO43716 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATCO43716 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATCO43716 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATCO43716 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATCO43716 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms