Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRXO43186 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRXO43186 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRXO43186 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRXO43186 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRXO43186 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRXO43186 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRXO43186 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRXO43186 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRXO43186 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRXO43186 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRXO43186 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRXO43186 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRXO43186 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRXO43186 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRXO43186 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRXO43186 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRXO43186 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRXO43186 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRXO43186 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRXO43186 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRXO43186 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRXO43186 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRXO43186 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRXO43186 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRXO43186 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRXO43186 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRXO43186 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRXO43186 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRXO43186 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRXO43186 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRXO43186 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRXO43186 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRXO43186 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRXO43186 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRXO43186 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRXO43186 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRXO43186 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRXO43186 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRXO43186 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRXO43186 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRXO43186 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRXO43186 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRXO43186 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRXO43186 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRXO43186 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRXO43186 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRXO43186 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRXO43186 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRXO43186 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRXO43186 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRXO43186 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRXO43186 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRXO43186 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRXO43186 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRXO43186 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRXO43186 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRXO43186 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRXO43186 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRXO43186 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRXO43186 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRXO43186 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRXO43186 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRXO43186 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRXO43186 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRXO43186 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRXO43186 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRXO43186 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRXO43186 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRXO43186 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRXO43186 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRXO43186 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRXO43186 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRXO43186 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRXO43186 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRXO43186 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRXO43186 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRXO43186 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRXO43186 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRXO43186 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRXO43186 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRXO43186 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRXO43186 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRXO43186 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRXO43186 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRXO43186 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRXO43186 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRXO43186 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRXO43186 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRXO43186 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRXO43186 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CRXO43186 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRXO43186 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRXO43186 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRXO43186 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms