Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUPL2O15504 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUPL2O15504 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUPL2O15504 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUPL2O15504 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUPL2O15504 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUPL2O15504 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUPL2O15504 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUPL2O15504 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUPL2O15504 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms