Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.814e-9■■■■■ 30.3
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NKRFO15226 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -19e-8■■■■■ 29.7
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NKRFO15226 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.319e-8■■■■■ 29.7
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NKRFO15226 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 29.5
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NKRFO15226 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 28.4
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NKRFO15226 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 28.4
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NKRFO15226 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 28.2
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NKRFO15226 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 28
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NKRFO15226 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.413e-8■■■■■ 28
NKRFO15226 WDR86-206ENST00000496971 565 ntTSL 323.66■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 28
NKRFO15226 SPATA13-209ENST00000466831 2191 ntTSL 221.29■■□□□ 13e-8■■■■■ 28
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NKRFO15226 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 28
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