Protein–RNA interactions for Protein: O15165

LDLRAD4, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4O15165 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD4O15165 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD4O15165 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD4O15165 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD4O15165 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDLRAD4O15165 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDLRAD4O15165 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAD4O15165 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAD4O15165 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDLRAD4O15165 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD4O15165 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD4O15165 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD4O15165 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD4O15165 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD4O15165 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD4O15165 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms