Protein–RNA interactions for Protein: A6NGS2

ERICH4, Glutamate-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERICH4A6NGS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERICH4A6NGS2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERICH4A6NGS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERICH4A6NGS2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERICH4A6NGS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERICH4A6NGS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERICH4A6NGS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERICH4A6NGS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERICH4A6NGS2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERICH4A6NGS2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERICH4A6NGS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERICH4A6NGS2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERICH4A6NGS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERICH4A6NGS2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERICH4A6NGS2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERICH4A6NGS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERICH4A6NGS2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERICH4A6NGS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERICH4A6NGS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERICH4A6NGS2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms