Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM30A4D0T7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM30A4D0T7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM30A4D0T7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM30A4D0T7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM30A4D0T7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM30A4D0T7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM30A4D0T7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM30A4D0T7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM30A4D0T7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms