Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCRBV5S2A0A599 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCRBV5S2A0A599 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCRBV5S2A0A599 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV5S2A0A599 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV5S2A0A599 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV5S2A0A599 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCRBV5S2A0A599 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV5S2A0A599 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S2A0A599 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCRBV5S2A0A599 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCRBV5S2A0A599 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCRBV5S2A0A599 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms