Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00854A0A1B0GVQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00854A0A1B0GVQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00854A0A1B0GVQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00854A0A1B0GVQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00854A0A1B0GVQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00854A0A1B0GVQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00854A0A1B0GVQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms