Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZRANB2-AS2-205ENST00000455406 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms