Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms