Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms