Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms