Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms