Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHDC9Q8NEP7 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms