Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSAMQ8N6F7 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms