Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms