Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms