Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms