Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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