Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms