Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms