Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms