Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms