Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E1P29083 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms