Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF4P18085 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF4P18085 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ARF4P18085 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARF4P18085 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ARF4P18085 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms