Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms