Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VIL1P09327 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VIL1P09327 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms