Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PKHD1P08F94 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms