Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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