Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LRIT1Q9P2V4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LRIT1Q9P2V4 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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LRIT1Q9P2V4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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