Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms