Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 COL4A6-203ENST00000394872 6750 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PDYN-201ENST00000217305 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CLIP1-214ENST00000540539 2592 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TMC3-202ENST00000558726 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RHOBTB2-205ENST00000519685 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NOD2-201ENST00000300589 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LINC00242-201ENST00000437615 2418 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC011337.1-201ENST00000606930 3317 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PPP1R17-201ENST00000342032 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SERAC1-205ENST00000607000 2284 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 DDR1-AS1-206ENST00000458361 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 BORA-206ENST00000613797 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 Metazoa_SRP.135-201ENST00000616324 269 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GIMAP4-201ENST00000255945 2060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CCDC112-202ENST00000395557 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ZFAT-216ENST00000523399 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CACNB4-246ENST00000637309 7409 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CFAP65-207ENST00000441968 3416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PRAMEF15-201ENST00000376152 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CLP1-203ENST00000529430 1778 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NUTM2A-AS1-205ENST00000420424 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 FCGR1A-201ENST00000369168 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TSHR-203ENST00000541158 4566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LMOD1-202ENST00000616739 3058 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MFSD4A-201ENST00000367147 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PIK3R3-204ENST00000423209 1884 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GRHL3-204ENST00000361548 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 POTED-201ENST00000299443 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms