Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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