Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA4P51532 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms