Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms