Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLD1P28340 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms