Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYN1P17600 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYN1P17600 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYN1P17600 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SYN1P17600 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYN1P17600 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYN1P17600 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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